Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRB2P47870 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABRB2P47870 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABRB2P47870 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABRB2P47870 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABRB2P47870 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABRB2P47870 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABRB2P47870 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABRB2P47870 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRB2P47870 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRB2P47870 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRB2P47870 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRB2P47870 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRB2P47870 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms