Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UTRNP46939 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UTRNP46939 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UTRNP46939 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UTRNP46939 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UTRNP46939 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UTRNP46939 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UTRNP46939 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UTRNP46939 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UTRNP46939 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UTRNP46939 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UTRNP46939 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UTRNP46939 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UTRNP46939 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UTRNP46939 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UTRNP46939 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UTRNP46939 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UTRNP46939 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UTRNP46939 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UTRNP46939 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UTRNP46939 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UTRNP46939 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UTRNP46939 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UTRNP46939 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UTRNP46939 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UTRNP46939 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UTRNP46939 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UTRNP46939 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UTRNP46939 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UTRNP46939 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UTRNP46939 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UTRNP46939 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UTRNP46939 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UTRNP46939 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UTRNP46939 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UTRNP46939 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UTRNP46939 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UTRNP46939 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UTRNP46939 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UTRNP46939 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UTRNP46939 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UTRNP46939 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UTRNP46939 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UTRNP46939 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UTRNP46939 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UTRNP46939 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UTRNP46939 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UTRNP46939 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UTRNP46939 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UTRNP46939 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UTRNP46939 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UTRNP46939 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UTRNP46939 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UTRNP46939 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UTRNP46939 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UTRNP46939 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UTRNP46939 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UTRNP46939 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UTRNP46939 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UTRNP46939 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UTRNP46939 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UTRNP46939 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UTRNP46939 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UTRNP46939 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UTRNP46939 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UTRNP46939 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UTRNP46939 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UTRNP46939 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UTRNP46939 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UTRNP46939 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UTRNP46939 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UTRNP46939 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UTRNP46939 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UTRNP46939 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UTRNP46939 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UTRNP46939 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UTRNP46939 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UTRNP46939 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UTRNP46939 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UTRNP46939 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UTRNP46939 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UTRNP46939 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UTRNP46939 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UTRNP46939 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UTRNP46939 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UTRNP46939 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UTRNP46939 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UTRNP46939 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UTRNP46939 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UTRNP46939 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UTRNP46939 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UTRNP46939 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UTRNP46939 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UTRNP46939 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UTRNP46939 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UTRNP46939 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UTRNP46939 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UTRNP46939 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UTRNP46939 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UTRNP46939 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms