Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms