Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF9P41273 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF9P41273 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF9P41273 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF9P41273 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF9P41273 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF9P41273 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF9P41273 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF9P41273 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF9P41273 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF9P41273 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF9P41273 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF9P41273 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF9P41273 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF9P41273 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF9P41273 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF9P41273 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF9P41273 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF9P41273 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF9P41273 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF9P41273 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF9P41273 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF9P41273 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF9P41273 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF9P41273 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF9P41273 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF9P41273 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF9P41273 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF9P41273 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF9P41273 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF9P41273 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF9P41273 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF9P41273 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF9P41273 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF9P41273 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF9P41273 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF9P41273 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF9P41273 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF9P41273 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF9P41273 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF9P41273 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF9P41273 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF9P41273 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF9P41273 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF9P41273 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF9P41273 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF9P41273 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF9P41273 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF9P41273 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF9P41273 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF9P41273 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF9P41273 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF9P41273 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF9P41273 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF9P41273 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNFSF9P41273 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNFSF9P41273 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNFSF9P41273 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF9P41273 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF9P41273 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF9P41273 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF9P41273 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF9P41273 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF9P41273 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF9P41273 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF9P41273 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF9P41273 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF9P41273 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms