Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDIT3P35638 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms