Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFTPDP35247 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFTPDP35247 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms