Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ABCD1P33897 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms