Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COL4A5P29400 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL4A5P29400 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms