Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GABRB3P28472 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms