Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLD1P28340 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLD1P28340 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLD1P28340 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLD1P28340 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLD1P28340 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLD1P28340 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLD1P28340 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLD1P28340 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLD1P28340 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLD1P28340 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLD1P28340 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLD1P28340 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLD1P28340 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLD1P28340 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLD1P28340 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLD1P28340 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLD1P28340 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLD1P28340 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLD1P28340 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
POLD1P28340 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLD1P28340 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLD1P28340 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLD1P28340 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLD1P28340 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLD1P28340 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLD1P28340 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLD1P28340 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLD1P28340 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLD1P28340 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLD1P28340 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLD1P28340 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLD1P28340 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLD1P28340 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLD1P28340 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLD1P28340 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLD1P28340 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLD1P28340 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLD1P28340 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLD1P28340 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POLD1P28340 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLD1P28340 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POLD1P28340 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLD1P28340 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POLD1P28340 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLD1P28340 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLD1P28340 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLD1P28340 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLD1P28340 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLD1P28340 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLD1P28340 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLD1P28340 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLD1P28340 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLD1P28340 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
POLD1P28340 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
POLD1P28340 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLD1P28340 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLD1P28340 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLD1P28340 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLD1P28340 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLD1P28340 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLD1P28340 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLD1P28340 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLD1P28340 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POLD1P28340 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POLD1P28340 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLD1P28340 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLD1P28340 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLD1P28340 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLD1P28340 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLD1P28340 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLD1P28340 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLD1P28340 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLD1P28340 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLD1P28340 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLD1P28340 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLD1P28340 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLD1P28340 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLD1P28340 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLD1P28340 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLD1P28340 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLD1P28340 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLD1P28340 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLD1P28340 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLD1P28340 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLD1P28340 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLD1P28340 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLD1P28340 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLD1P28340 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLD1P28340 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLD1P28340 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLD1P28340 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
POLD1P28340 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLD1P28340 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLD1P28340 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLD1P28340 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLD1P28340 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLD1P28340 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
POLD1P28340 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLD1P28340 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms