Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGB2P26583 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGB2P26583 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms