Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKCHP24723 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PRKCHP24723 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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