Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMPD1P17405 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMPD1P17405 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms