Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF3P17036 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms