Protein–RNA interactions for Protein: P15822

HIVEP1, Zinc finger protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 2,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP1P15822 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIVEP1P15822 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIVEP1P15822 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIVEP1P15822 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIVEP1P15822 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIVEP1P15822 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIVEP1P15822 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIVEP1P15822 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIVEP1P15822 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIVEP1P15822 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIVEP1P15822 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIVEP1P15822 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIVEP1P15822 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIVEP1P15822 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms