Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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