Protein–RNA interactions for Protein: P11274

BCR, Breakpoint cluster region protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCRP11274 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCRP11274 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCRP11274 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCRP11274 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCRP11274 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCRP11274 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BCRP11274 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCRP11274 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCRP11274 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCRP11274 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCRP11274 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BCRP11274 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCRP11274 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCRP11274 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCRP11274 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCRP11274 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCRP11274 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCRP11274 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCRP11274 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCRP11274 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCRP11274 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCRP11274 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCRP11274 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCRP11274 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCRP11274 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCRP11274 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCRP11274 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCRP11274 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCRP11274 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCRP11274 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCRP11274 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCRP11274 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BCRP11274 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCRP11274 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCRP11274 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BCRP11274 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCRP11274 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCRP11274 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCRP11274 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCRP11274 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BCRP11274 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCRP11274 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCRP11274 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCRP11274 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCRP11274 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCRP11274 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCRP11274 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BCRP11274 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCRP11274 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCRP11274 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCRP11274 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCRP11274 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCRP11274 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCRP11274 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCRP11274 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCRP11274 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCRP11274 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCRP11274 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCRP11274 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCRP11274 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCRP11274 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCRP11274 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCRP11274 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCRP11274 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCRP11274 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCRP11274 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BCRP11274 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCRP11274 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCRP11274 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCRP11274 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCRP11274 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCRP11274 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BCRP11274 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCRP11274 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCRP11274 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCRP11274 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCRP11274 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCRP11274 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCRP11274 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCRP11274 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCRP11274 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCRP11274 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCRP11274 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCRP11274 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCRP11274 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCRP11274 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCRP11274 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCRP11274 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCRP11274 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BCRP11274 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCRP11274 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BCRP11274 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCRP11274 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCRP11274 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCRP11274 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCRP11274 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BCRP11274 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BCRP11274 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCRP11274 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCRP11274 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms