Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMC1P11047 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMC1P11047 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms