Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF1P10914 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF1P10914 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IRF1P10914 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF1P10914 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF1P10914 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF1P10914 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF1P10914 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF1P10914 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF1P10914 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF1P10914 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF1P10914 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF1P10914 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF1P10914 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF1P10914 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF1P10914 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF1P10914 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF1P10914 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF1P10914 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF1P10914 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF1P10914 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF1P10914 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF1P10914 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF1P10914 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF1P10914 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF1P10914 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF1P10914 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF1P10914 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF1P10914 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF1P10914 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF1P10914 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
IRF1P10914 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF1P10914 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF1P10914 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF1P10914 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF1P10914 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF1P10914 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF1P10914 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF1P10914 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF1P10914 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF1P10914 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF1P10914 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF1P10914 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF1P10914 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF1P10914 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF1P10914 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF1P10914 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF1P10914 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF1P10914 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF1P10914 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF1P10914 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF1P10914 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF1P10914 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF1P10914 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF1P10914 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF1P10914 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF1P10914 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF1P10914 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF1P10914 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IRF1P10914 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF1P10914 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF1P10914 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF1P10914 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF1P10914 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF1P10914 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF1P10914 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF1P10914 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF1P10914 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF1P10914 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF1P10914 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF1P10914 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF1P10914 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF1P10914 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF1P10914 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF1P10914 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF1P10914 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF1P10914 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF1P10914 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF1P10914 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF1P10914 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IRF1P10914 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF1P10914 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF1P10914 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF1P10914 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF1P10914 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF1P10914 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF1P10914 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF1P10914 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF1P10914 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF1P10914 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF1P10914 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF1P10914 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF1P10914 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF1P10914 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF1P10914 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF1P10914 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF1P10914 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF1P10914 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF1P10914 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IRF1P10914 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms