Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP10P09238 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP10P09238 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP10P09238 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP10P09238 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP10P09238 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP10P09238 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP10P09238 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP10P09238 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP10P09238 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP10P09238 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP10P09238 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP10P09238 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP10P09238 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP10P09238 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP10P09238 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP10P09238 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP10P09238 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP10P09238 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP10P09238 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP10P09238 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP10P09238 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP10P09238 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP10P09238 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP10P09238 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP10P09238 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP10P09238 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP10P09238 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP10P09238 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP10P09238 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP10P09238 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP10P09238 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP10P09238 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP10P09238 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP10P09238 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP10P09238 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP10P09238 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP10P09238 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP10P09238 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP10P09238 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP10P09238 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP10P09238 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP10P09238 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP10P09238 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP10P09238 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP10P09238 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP10P09238 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP10P09238 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP10P09238 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP10P09238 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP10P09238 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP10P09238 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP10P09238 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP10P09238 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP10P09238 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP10P09238 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP10P09238 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP10P09238 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP10P09238 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP10P09238 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP10P09238 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP10P09238 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP10P09238 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP10P09238 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP10P09238 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP10P09238 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP10P09238 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP10P09238 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP10P09238 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP10P09238 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP10P09238 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP10P09238 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP10P09238 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP10P09238 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP10P09238 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP10P09238 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP10P09238 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP10P09238 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP10P09238 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP10P09238 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP10P09238 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP10P09238 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP10P09238 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP10P09238 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP10P09238 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP10P09238 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP10P09238 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP10P09238 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP10P09238 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP10P09238 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP10P09238 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP10P09238 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP10P09238 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP10P09238 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP10P09238 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP10P09238 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP10P09238 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP10P09238 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP10P09238 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP10P09238 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms