Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACAA1P09110 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACAA1P09110 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms