Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYMSP04818 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYMSP04818 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYMSP04818 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYMSP04818 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYMSP04818 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYMSP04818 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYMSP04818 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TYMSP04818 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYMSP04818 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TYMSP04818 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TYMSP04818 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TYMSP04818 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TYMSP04818 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TYMSP04818 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYMSP04818 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYMSP04818 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYMSP04818 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYMSP04818 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYMSP04818 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYMSP04818 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYMSP04818 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYMSP04818 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYMSP04818 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYMSP04818 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYMSP04818 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYMSP04818 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TYMSP04818 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TYMSP04818 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TYMSP04818 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TYMSP04818 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TYMSP04818 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TYMSP04818 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TYMSP04818 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TYMSP04818 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TYMSP04818 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TYMSP04818 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TYMSP04818 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TYMSP04818 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TYMSP04818 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TYMSP04818 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TYMSP04818 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TYMSP04818 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TYMSP04818 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TYMSP04818 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TYMSP04818 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TYMSP04818 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TYMSP04818 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TYMSP04818 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TYMSP04818 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TYMSP04818 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TYMSP04818 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TYMSP04818 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TYMSP04818 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TYMSP04818 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TYMSP04818 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TYMSP04818 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TYMSP04818 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TYMSP04818 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TYMSP04818 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TYMSP04818 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TYMSP04818 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TYMSP04818 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TYMSP04818 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TYMSP04818 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TYMSP04818 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TYMSP04818 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TYMSP04818 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TYMSP04818 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TYMSP04818 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TYMSP04818 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TYMSP04818 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TYMSP04818 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TYMSP04818 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TYMSP04818 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TYMSP04818 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TYMSP04818 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TYMSP04818 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TYMSP04818 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TYMSP04818 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TYMSP04818 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TYMSP04818 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TYMSP04818 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TYMSP04818 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TYMSP04818 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TYMSP04818 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TYMSP04818 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TYMSP04818 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TYMSP04818 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TYMSP04818 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TYMSP04818 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TYMSP04818 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TYMSP04818 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TYMSP04818 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TYMSP04818 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TYMSP04818 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TYMSP04818 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TYMSP04818 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TYMSP04818 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TYMSP04818 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms