Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYCNP04198 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYCNP04198 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYCNP04198 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYCNP04198 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYCNP04198 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYCNP04198 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYCNP04198 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYCNP04198 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYCNP04198 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYCNP04198 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYCNP04198 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYCNP04198 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYCNP04198 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYCNP04198 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYCNP04198 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYCNP04198 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYCNP04198 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYCNP04198 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYCNP04198 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYCNP04198 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYCNP04198 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYCNP04198 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYCNP04198 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYCNP04198 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYCNP04198 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYCNP04198 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYCNP04198 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYCNP04198 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYCNP04198 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYCNP04198 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYCNP04198 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYCNP04198 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYCNP04198 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYCNP04198 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYCNP04198 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYCNP04198 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MYCNP04198 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYCNP04198 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MYCNP04198 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYCNP04198 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYCNP04198 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MYCNP04198 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYCNP04198 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYCNP04198 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYCNP04198 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYCNP04198 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYCNP04198 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYCNP04198 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYCNP04198 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYCNP04198 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYCNP04198 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYCNP04198 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYCNP04198 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYCNP04198 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYCNP04198 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYCNP04198 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYCNP04198 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYCNP04198 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYCNP04198 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYCNP04198 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYCNP04198 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYCNP04198 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYCNP04198 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYCNP04198 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYCNP04198 TSPAN5-202ENST00000505184 1191 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYCNP04198 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYCNP04198 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYCNP04198 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYCNP04198 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYCNP04198 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYCNP04198 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYCNP04198 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYCNP04198 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYCNP04198 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MYCNP04198 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYCNP04198 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYCNP04198 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYCNP04198 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYCNP04198 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYCNP04198 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYCNP04198 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYCNP04198 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYCNP04198 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYCNP04198 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYCNP04198 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MYCNP04198 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MYCNP04198 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYCNP04198 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYCNP04198 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYCNP04198 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYCNP04198 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MYCNP04198 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYCNP04198 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYCNP04198 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYCNP04198 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MYCNP04198 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYCNP04198 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYCNP04198 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MYCNP04198 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms