Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBX7O95931 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CBX7O95931 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBX7O95931 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBX7O95931 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBX7O95931 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CBX7O95931 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX7O95931 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX7O95931 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX7O95931 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX7O95931 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX7O95931 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX7O95931 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX7O95931 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX7O95931 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX7O95931 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX7O95931 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX7O95931 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX7O95931 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX7O95931 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX7O95931 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX7O95931 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX7O95931 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX7O95931 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX7O95931 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX7O95931 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX7O95931 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX7O95931 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX7O95931 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CBX7O95931 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX7O95931 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX7O95931 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX7O95931 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX7O95931 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX7O95931 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX7O95931 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX7O95931 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX7O95931 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX7O95931 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX7O95931 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX7O95931 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX7O95931 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX7O95931 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX7O95931 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX7O95931 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX7O95931 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX7O95931 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX7O95931 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX7O95931 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX7O95931 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX7O95931 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX7O95931 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX7O95931 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX7O95931 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX7O95931 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX7O95931 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX7O95931 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX7O95931 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX7O95931 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX7O95931 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CBX7O95931 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX7O95931 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX7O95931 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX7O95931 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX7O95931 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX7O95931 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX7O95931 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX7O95931 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX7O95931 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX7O95931 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX7O95931 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX7O95931 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX7O95931 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX7O95931 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX7O95931 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX7O95931 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX7O95931 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX7O95931 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX7O95931 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX7O95931 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX7O95931 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX7O95931 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX7O95931 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX7O95931 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX7O95931 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX7O95931 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX7O95931 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX7O95931 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX7O95931 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX7O95931 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX7O95931 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CBX7O95931 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX7O95931 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX7O95931 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX7O95931 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX7O95931 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX7O95931 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX7O95931 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX7O95931 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX7O95931 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms