Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYF2O95926 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYF2O95926 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYF2O95926 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SYF2O95926 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYF2O95926 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYF2O95926 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYF2O95926 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYF2O95926 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYF2O95926 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYF2O95926 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYF2O95926 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYF2O95926 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYF2O95926 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYF2O95926 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SYF2O95926 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYF2O95926 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYF2O95926 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYF2O95926 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYF2O95926 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYF2O95926 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYF2O95926 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYF2O95926 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYF2O95926 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYF2O95926 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYF2O95926 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYF2O95926 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYF2O95926 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYF2O95926 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYF2O95926 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYF2O95926 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYF2O95926 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYF2O95926 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYF2O95926 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYF2O95926 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYF2O95926 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYF2O95926 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYF2O95926 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SYF2O95926 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SYF2O95926 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SYF2O95926 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYF2O95926 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYF2O95926 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYF2O95926 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYF2O95926 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYF2O95926 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYF2O95926 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYF2O95926 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYF2O95926 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYF2O95926 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SYF2O95926 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYF2O95926 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYF2O95926 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYF2O95926 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SYF2O95926 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYF2O95926 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYF2O95926 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYF2O95926 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SYF2O95926 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYF2O95926 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYF2O95926 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYF2O95926 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYF2O95926 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYF2O95926 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SYF2O95926 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYF2O95926 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYF2O95926 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYF2O95926 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYF2O95926 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYF2O95926 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYF2O95926 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYF2O95926 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYF2O95926 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYF2O95926 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYF2O95926 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYF2O95926 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYF2O95926 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYF2O95926 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYF2O95926 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYF2O95926 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYF2O95926 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYF2O95926 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYF2O95926 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYF2O95926 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYF2O95926 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYF2O95926 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SYF2O95926 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYF2O95926 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYF2O95926 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYF2O95926 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYF2O95926 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYF2O95926 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYF2O95926 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYF2O95926 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYF2O95926 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYF2O95926 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYF2O95926 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYF2O95926 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SYF2O95926 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYF2O95926 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms