Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX58O95786 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX58O95786 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX58O95786 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX58O95786 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX58O95786 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX58O95786 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX58O95786 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX58O95786 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX58O95786 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX58O95786 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX58O95786 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX58O95786 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX58O95786 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX58O95786 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX58O95786 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX58O95786 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX58O95786 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX58O95786 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX58O95786 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX58O95786 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX58O95786 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX58O95786 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX58O95786 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX58O95786 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX58O95786 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX58O95786 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX58O95786 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX58O95786 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX58O95786 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX58O95786 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX58O95786 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX58O95786 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX58O95786 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX58O95786 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX58O95786 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX58O95786 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX58O95786 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX58O95786 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX58O95786 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX58O95786 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX58O95786 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX58O95786 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX58O95786 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX58O95786 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX58O95786 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX58O95786 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX58O95786 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX58O95786 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX58O95786 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX58O95786 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX58O95786 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX58O95786 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX58O95786 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX58O95786 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX58O95786 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX58O95786 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX58O95786 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX58O95786 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX58O95786 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX58O95786 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX58O95786 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX58O95786 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX58O95786 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX58O95786 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX58O95786 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX58O95786 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX58O95786 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX58O95786 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX58O95786 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX58O95786 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX58O95786 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX58O95786 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX58O95786 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX58O95786 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX58O95786 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX58O95786 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX58O95786 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX58O95786 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX58O95786 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX58O95786 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX58O95786 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX58O95786 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX58O95786 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX58O95786 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX58O95786 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX58O95786 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX58O95786 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX58O95786 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX58O95786 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX58O95786 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX58O95786 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX58O95786 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX58O95786 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX58O95786 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX58O95786 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX58O95786 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX58O95786 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX58O95786 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX58O95786 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms