Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF4AO95239 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KIF4AO95239 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms