Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SKAP2O75563 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKAP2O75563 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms