Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP9AO75110 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms