Protein–RNA interactions for Protein: O75063

FAM20B, Glycosaminoglycan xylosylkinase, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20BO75063 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM20BO75063 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms