Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNSO60931 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNSO60931 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNSO60931 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNSO60931 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNSO60931 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNSO60931 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNSO60931 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNSO60931 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNSO60931 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNSO60931 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNSO60931 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNSO60931 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNSO60931 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNSO60931 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNSO60931 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNSO60931 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNSO60931 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNSO60931 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNSO60931 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNSO60931 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNSO60931 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNSO60931 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNSO60931 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNSO60931 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNSO60931 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNSO60931 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNSO60931 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNSO60931 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNSO60931 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNSO60931 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNSO60931 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNSO60931 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNSO60931 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNSO60931 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNSO60931 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNSO60931 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNSO60931 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNSO60931 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNSO60931 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNSO60931 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNSO60931 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNSO60931 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNSO60931 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNSO60931 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNSO60931 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNSO60931 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNSO60931 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNSO60931 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNSO60931 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNSO60931 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNSO60931 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNSO60931 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNSO60931 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNSO60931 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNSO60931 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNSO60931 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNSO60931 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNSO60931 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNSO60931 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNSO60931 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNSO60931 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNSO60931 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNSO60931 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNSO60931 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNSO60931 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNSO60931 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNSO60931 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNSO60931 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNSO60931 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNSO60931 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNSO60931 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNSO60931 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTNSO60931 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTNSO60931 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTNSO60931 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTNSO60931 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTNSO60931 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNSO60931 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNSO60931 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNSO60931 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNSO60931 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNSO60931 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNSO60931 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNSO60931 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNSO60931 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNSO60931 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNSO60931 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNSO60931 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNSO60931 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNSO60931 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNSO60931 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNSO60931 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNSO60931 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNSO60931 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNSO60931 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNSO60931 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNSO60931 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNSO60931 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTNSO60931 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms