Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PLXNC1O60486 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLXNC1O60486 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLXNC1O60486 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLXNC1O60486 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLXNC1O60486 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLXNC1O60486 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLXNC1O60486 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLXNC1O60486 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLXNC1O60486 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLXNC1O60486 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PLXNC1O60486 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLXNC1O60486 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLXNC1O60486 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLXNC1O60486 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLXNC1O60486 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PLXNC1O60486 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLXNC1O60486 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLXNC1O60486 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLXNC1O60486 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLXNC1O60486 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLXNC1O60486 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PLXNC1O60486 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms