Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP10AO60312 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP10AO60312 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP10AO60312 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP10AO60312 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP10AO60312 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP10AO60312 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP10AO60312 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP10AO60312 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP10AO60312 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP10AO60312 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP10AO60312 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP10AO60312 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP10AO60312 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP10AO60312 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP10AO60312 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP10AO60312 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP10AO60312 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP10AO60312 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP10AO60312 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP10AO60312 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP10AO60312 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP10AO60312 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP10AO60312 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP10AO60312 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP10AO60312 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms