Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MSH5O43196 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MSH5O43196 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MSH5O43196 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MSH5O43196 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MSH5O43196 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MSH5O43196 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MSH5O43196 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MSH5O43196 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MSH5O43196 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MSH5O43196 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MSH5O43196 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MSH5O43196 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MSH5O43196 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MSH5O43196 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MSH5O43196 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MSH5O43196 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MSH5O43196 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MSH5O43196 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MSH5O43196 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSH5O43196 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSH5O43196 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSH5O43196 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSH5O43196 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSH5O43196 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSH5O43196 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSH5O43196 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSH5O43196 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSH5O43196 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSH5O43196 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSH5O43196 AC068205.1-201ENST00000526615 689 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSH5O43196 AC073611.1-201ENST00000550263 647 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSH5O43196 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSH5O43196 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSH5O43196 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MSH5O43196 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSH5O43196 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MSH5O43196 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSH5O43196 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSH5O43196 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSH5O43196 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSH5O43196 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSH5O43196 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSH5O43196 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MSH5O43196 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSH5O43196 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSH5O43196 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSH5O43196 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSH5O43196 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSH5O43196 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSH5O43196 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSH5O43196 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSH5O43196 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSH5O43196 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSH5O43196 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSH5O43196 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSH5O43196 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSH5O43196 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSH5O43196 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSH5O43196 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSH5O43196 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSH5O43196 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSH5O43196 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSH5O43196 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MSH5O43196 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSH5O43196 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSH5O43196 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSH5O43196 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSH5O43196 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSH5O43196 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSH5O43196 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSH5O43196 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSH5O43196 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSH5O43196 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSH5O43196 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSH5O43196 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSH5O43196 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSH5O43196 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSH5O43196 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSH5O43196 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSH5O43196 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSH5O43196 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSH5O43196 AP001981.1-201ENST00000531132 738 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MSH5O43196 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSH5O43196 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSH5O43196 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSH5O43196 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSH5O43196 UCHL3-206ENST00000618773 1050 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSH5O43196 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSH5O43196 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSH5O43196 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSH5O43196 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSH5O43196 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSH5O43196 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSH5O43196 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MSH5O43196 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MSH5O43196 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MSH5O43196 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MSH5O43196 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MSH5O43196 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms