Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VGFO15240 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VGFO15240 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
VGFO15240 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VGFO15240 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VGFO15240 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VGFO15240 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VGFO15240 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VGFO15240 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VGFO15240 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VGFO15240 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VGFO15240 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VGFO15240 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VGFO15240 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
VGFO15240 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VGFO15240 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VGFO15240 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VGFO15240 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
VGFO15240 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VGFO15240 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VGFO15240 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VGFO15240 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VGFO15240 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VGFO15240 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VGFO15240 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VGFO15240 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VGFO15240 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VGFO15240 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VGFO15240 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VGFO15240 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VGFO15240 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VGFO15240 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VGFO15240 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VGFO15240 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VGFO15240 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
VGFO15240 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VGFO15240 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VGFO15240 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VGFO15240 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VGFO15240 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VGFO15240 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VGFO15240 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VGFO15240 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
VGFO15240 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
VGFO15240 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VGFO15240 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VGFO15240 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VGFO15240 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VGFO15240 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VGFO15240 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VGFO15240 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VGFO15240 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VGFO15240 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VGFO15240 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VGFO15240 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VGFO15240 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VGFO15240 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VGFO15240 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VGFO15240 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VGFO15240 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VGFO15240 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VGFO15240 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
VGFO15240 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VGFO15240 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VGFO15240 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VGFO15240 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VGFO15240 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
VGFO15240 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
VGFO15240 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
VGFO15240 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VGFO15240 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VGFO15240 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VGFO15240 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VGFO15240 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VGFO15240 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VGFO15240 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VGFO15240 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
VGFO15240 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VGFO15240 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VGFO15240 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
VGFO15240 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VGFO15240 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VGFO15240 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VGFO15240 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VGFO15240 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VGFO15240 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VGFO15240 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VGFO15240 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VGFO15240 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VGFO15240 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VGFO15240 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VGFO15240 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
VGFO15240 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VGFO15240 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VGFO15240 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
VGFO15240 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VGFO15240 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VGFO15240 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
VGFO15240 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VGFO15240 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms