Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNPHO15079 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNPHO15079 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNPHO15079 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNPHO15079 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNPHO15079 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNPHO15079 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNPHO15079 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNPHO15079 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNPHO15079 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNPHO15079 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNPHO15079 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNPHO15079 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNPHO15079 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNPHO15079 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNPHO15079 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNPHO15079 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNPHO15079 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNPHO15079 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNPHO15079 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNPHO15079 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNPHO15079 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNPHO15079 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNPHO15079 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNPHO15079 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNPHO15079 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNPHO15079 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNPHO15079 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNPHO15079 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNPHO15079 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNPHO15079 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNPHO15079 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNPHO15079 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNPHO15079 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNPHO15079 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNPHO15079 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNPHO15079 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNPHO15079 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNPHO15079 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNPHO15079 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNPHO15079 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNPHO15079 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNPHO15079 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNPHO15079 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNPHO15079 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNPHO15079 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNPHO15079 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNPHO15079 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNPHO15079 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNPHO15079 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNPHO15079 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNPHO15079 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNPHO15079 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNPHO15079 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNPHO15079 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNPHO15079 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
SNPHO15079 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNPHO15079 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNPHO15079 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNPHO15079 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNPHO15079 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNPHO15079 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNPHO15079 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNPHO15079 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNPHO15079 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNPHO15079 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNPHO15079 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNPHO15079 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNPHO15079 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNPHO15079 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNPHO15079 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNPHO15079 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNPHO15079 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNPHO15079 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNPHO15079 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNPHO15079 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNPHO15079 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNPHO15079 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNPHO15079 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNPHO15079 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNPHO15079 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNPHO15079 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNPHO15079 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNPHO15079 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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