Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3EO15041 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms