Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASKO14936 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASKO14936 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CASKO14936 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASKO14936 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CASKO14936 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASKO14936 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASKO14936 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASKO14936 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASKO14936 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASKO14936 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASKO14936 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASKO14936 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASKO14936 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASKO14936 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASKO14936 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASKO14936 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASKO14936 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASKO14936 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASKO14936 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASKO14936 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASKO14936 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASKO14936 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASKO14936 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASKO14936 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASKO14936 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASKO14936 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASKO14936 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASKO14936 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASKO14936 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASKO14936 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASKO14936 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASKO14936 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASKO14936 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASKO14936 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASKO14936 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASKO14936 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASKO14936 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASKO14936 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASKO14936 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASKO14936 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASKO14936 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASKO14936 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASKO14936 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASKO14936 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASKO14936 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASKO14936 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASKO14936 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASKO14936 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASKO14936 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASKO14936 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASKO14936 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASKO14936 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASKO14936 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASKO14936 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASKO14936 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASKO14936 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASKO14936 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASKO14936 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASKO14936 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASKO14936 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASKO14936 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASKO14936 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASKO14936 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CASKO14936 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASKO14936 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASKO14936 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASKO14936 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASKO14936 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASKO14936 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASKO14936 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASKO14936 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CASKO14936 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASKO14936 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASKO14936 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASKO14936 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASKO14936 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASKO14936 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASKO14936 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASKO14936 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASKO14936 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASKO14936 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASKO14936 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASKO14936 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASKO14936 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASKO14936 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASKO14936 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASKO14936 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASKO14936 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASKO14936 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASKO14936 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASKO14936 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASKO14936 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASKO14936 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASKO14936 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASKO14936 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASKO14936 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CASKO14936 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CASKO14936 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASKO14936 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms