Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IRF6O14896 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IRF6O14896 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF6O14896 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF6O14896 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF6O14896 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF6O14896 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF6O14896 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF6O14896 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF6O14896 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF6O14896 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF6O14896 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF6O14896 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF6O14896 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF6O14896 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF6O14896 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF6O14896 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF6O14896 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF6O14896 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF6O14896 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF6O14896 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF6O14896 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF6O14896 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF6O14896 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF6O14896 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF6O14896 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF6O14896 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF6O14896 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF6O14896 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF6O14896 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF6O14896 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF6O14896 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF6O14896 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF6O14896 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF6O14896 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF6O14896 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF6O14896 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF6O14896 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF6O14896 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF6O14896 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF6O14896 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF6O14896 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF6O14896 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF6O14896 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF6O14896 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF6O14896 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF6O14896 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF6O14896 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF6O14896 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF6O14896 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF6O14896 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF6O14896 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF6O14896 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF6O14896 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF6O14896 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF6O14896 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF6O14896 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF6O14896 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF6O14896 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF6O14896 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF6O14896 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF6O14896 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF6O14896 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF6O14896 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF6O14896 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF6O14896 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF6O14896 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF6O14896 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF6O14896 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF6O14896 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF6O14896 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF6O14896 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF6O14896 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF6O14896 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF6O14896 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF6O14896 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF6O14896 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF6O14896 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF6O14896 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF6O14896 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF6O14896 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF6O14896 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF6O14896 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF6O14896 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF6O14896 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF6O14896 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF6O14896 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF6O14896 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF6O14896 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF6O14896 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF6O14896 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF6O14896 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF6O14896 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF6O14896 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF6O14896 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF6O14896 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF6O14896 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF6O14896 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF6O14896 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF6O14896 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms