Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIP1O00291 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIP1O00291 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIP1O00291 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIP1O00291 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIP1O00291 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIP1O00291 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HIP1O00291 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIP1O00291 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIP1O00291 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIP1O00291 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIP1O00291 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIP1O00291 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIP1O00291 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIP1O00291 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIP1O00291 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIP1O00291 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIP1O00291 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIP1O00291 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIP1O00291 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIP1O00291 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIP1O00291 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIP1O00291 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIP1O00291 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIP1O00291 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIP1O00291 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIP1O00291 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIP1O00291 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIP1O00291 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIP1O00291 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIP1O00291 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIP1O00291 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIP1O00291 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIP1O00291 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIP1O00291 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIP1O00291 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIP1O00291 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIP1O00291 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIP1O00291 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIP1O00291 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIP1O00291 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIP1O00291 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIP1O00291 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIP1O00291 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIP1O00291 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIP1O00291 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIP1O00291 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIP1O00291 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIP1O00291 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIP1O00291 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIP1O00291 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIP1O00291 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIP1O00291 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIP1O00291 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIP1O00291 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIP1O00291 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIP1O00291 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIP1O00291 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIP1O00291 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIP1O00291 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIP1O00291 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIP1O00291 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIP1O00291 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIP1O00291 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIP1O00291 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIP1O00291 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIP1O00291 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIP1O00291 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIP1O00291 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIP1O00291 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIP1O00291 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HIP1O00291 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIP1O00291 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HIP1O00291 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIP1O00291 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIP1O00291 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIP1O00291 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HIP1O00291 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIP1O00291 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIP1O00291 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIP1O00291 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIP1O00291 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIP1O00291 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIP1O00291 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIP1O00291 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HIP1O00291 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIP1O00291 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIP1O00291 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIP1O00291 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIP1O00291 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIP1O00291 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIP1O00291 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIP1O00291 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIP1O00291 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIP1O00291 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIP1O00291 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIP1O00291 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIP1O00291 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIP1O00291 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIP1O00291 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms