Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNAP23O00161 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms