Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
E9PCH4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
E9PCH4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
E9PCH4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
E9PCH4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
E9PCH4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
E9PCH4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
E9PCH4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
E9PCH4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
E9PCH4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
E9PCH4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
E9PCH4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
E9PCH4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
E9PCH4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
E9PCH4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
E9PCH4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
E9PCH4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
E9PCH4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
E9PCH4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
E9PCH4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
E9PCH4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
E9PCH4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
E9PCH4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
E9PCH4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
E9PCH4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
E9PCH4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
E9PCH4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
E9PCH4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
E9PCH4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
E9PCH4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
E9PCH4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
E9PCH4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
E9PCH4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
E9PCH4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
E9PCH4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
E9PCH4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
E9PCH4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
E9PCH4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
E9PCH4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
E9PCH4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
E9PCH4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
E9PCH4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
E9PCH4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
E9PCH4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
E9PCH4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
E9PCH4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
E9PCH4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
E9PCH4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
E9PCH4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
E9PCH4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
E9PCH4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
E9PCH4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
E9PCH4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
E9PCH4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
E9PCH4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
E9PCH4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
E9PCH4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
E9PCH4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
E9PCH4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
E9PCH4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
E9PCH4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
E9PCH4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
E9PCH4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
E9PCH4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
E9PCH4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
E9PCH4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
E9PCH4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
E9PCH4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
E9PCH4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
E9PCH4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
E9PCH4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
E9PCH4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
E9PCH4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
E9PCH4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
E9PCH4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
E9PCH4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
E9PCH4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
E9PCH4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
E9PCH4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
E9PCH4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
E9PCH4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
E9PCH4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
E9PCH4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
E9PCH4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
E9PCH4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
E9PCH4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
E9PCH4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
E9PCH4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
E9PCH4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
E9PCH4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
E9PCH4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
E9PCH4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
E9PCH4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
E9PCH4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
E9PCH4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
E9PCH4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
E9PCH4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
E9PCH4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
E9PCH4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
E9PCH4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms