Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf172C9J069 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms