Protein–RNA interactions for Protein: B4DSR2

cDNA FLJ52234, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DSR2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DSR2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DSR2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DSR2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DSR2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DSR2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DSR2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DSR2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DSR2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DSR2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DSR2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DSR2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DSR2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DSR2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DSR2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B4DSR2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B4DSR2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B4DSR2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
B4DSR2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DSR2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DSR2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DSR2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DSR2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DSR2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DSR2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DSR2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DSR2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DSR2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DSR2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DSR2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DSR2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DSR2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DSR2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DSR2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DSR2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DSR2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DSR2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DSR2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DSR2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DSR2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DSR2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DSR2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DSR2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DSR2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DSR2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DSR2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DSR2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DSR2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DSR2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DSR2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DSR2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DSR2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DSR2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DSR2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DSR2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DSR2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DSR2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DSR2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DSR2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DSR2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DSR2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DSR2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DSR2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DSR2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DSR2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DSR2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DSR2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms