Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SRRM5B3KS81 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms