Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ODF3BA8MYP8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ODF3BA8MYP8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms