Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A8MVJ9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A8MVJ9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A8MVJ9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A8MVJ9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A8MVJ9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A8MVJ9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
A8MVJ9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A8MVJ9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A8MVJ9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A8MVJ9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A8MVJ9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A8MVJ9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A8MVJ9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A8MVJ9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A8MVJ9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A8MVJ9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A8MVJ9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A8MVJ9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
A8MVJ9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A8MVJ9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A8MVJ9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A8MVJ9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A8MVJ9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A8MVJ9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A8MVJ9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A8MVJ9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A8MVJ9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A8MVJ9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A8MVJ9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A8MVJ9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A8MVJ9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A8MVJ9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A8MVJ9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A8MVJ9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A8MVJ9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A8MVJ9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A8MVJ9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A8MVJ9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A8MVJ9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A8MVJ9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
A8MVJ9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
A8MVJ9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
A8MVJ9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A8MVJ9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A8MVJ9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A8MVJ9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A8MVJ9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A8MVJ9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A8MVJ9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A8MVJ9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A8MVJ9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A8MVJ9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A8MVJ9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A8MVJ9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
A8MVJ9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
A8MVJ9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
A8MVJ9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
A8MVJ9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
A8MVJ9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
A8MVJ9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
A8MVJ9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
A8MVJ9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
A8MVJ9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
A8MVJ9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A8MVJ9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A8MVJ9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A8MVJ9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A8MVJ9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A8MVJ9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A8MVJ9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A8MVJ9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A8MVJ9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A8MVJ9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A8MVJ9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A8MVJ9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A8MVJ9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A8MVJ9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A8MVJ9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A8MVJ9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A8MVJ9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A8MVJ9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A8MVJ9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
A8MVJ9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A8MVJ9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A8MVJ9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A8MVJ9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A8MVJ9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A8MVJ9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A8MVJ9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A8MVJ9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A8MVJ9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A8MVJ9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A8MVJ9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A8MVJ9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A8MVJ9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A8MVJ9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A8MVJ9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A8MVJ9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A8MVJ9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms