Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD3A6NKT7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGPD3A6NKT7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms