Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF316A6NFI3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF316A6NFI3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms