Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POTEFA5A3E0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEFA5A3E0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEFA5A3E0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEFA5A3E0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEFA5A3E0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEFA5A3E0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEFA5A3E0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEFA5A3E0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEFA5A3E0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEFA5A3E0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEFA5A3E0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEFA5A3E0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEFA5A3E0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEFA5A3E0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEFA5A3E0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POTEFA5A3E0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEFA5A3E0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEFA5A3E0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEFA5A3E0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEFA5A3E0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEFA5A3E0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEFA5A3E0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEFA5A3E0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEFA5A3E0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEFA5A3E0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POTEFA5A3E0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms